Una vez descubiertas las verdaderas intenciones de Dio, quien ya tiene la máscara en su poder y está decidido a dominar el mundo, Jojo debe luchar para detenerlo; y esta pelea se extenderá por otros lugares y contra otros personajes, entre ellos Jack el Destripador y dos guerreros de la antigüedad. Sin embargo, Jojo también obtendrá ayuda de un personaje, excéntrico pero muy efectivo, quien le enseñará a usar una fuerza que es la antítesis de la máscara y de la maldad de Dios.